櫻桃樹冬季休眠期病蟲害綜合防治應采用人工和農業的方法，清理果園，消除越冬病蟲害源，有效消除有害生物，降低越冬基礎。
1、清掃落葉：落葉是許多病蟲害的主要越冬部位之一，如櫻桃褐斑、黑色輪紋病等病菌在受害葉片上越冬，卷葉蛾等害蟲潛伏在受害葉片上越冬。櫻桃落葉結束后，徹底清理落葉，掩埋或直接堆肥，消除落葉越冬病蟲害，可大大降低次年病蟲害基數。
2、結合修剪，切除病蟲枝：冬季修剪是櫻桃樹管理的重要技術措施也是休眠期消除越冬病蟲害的有效途徑。修剪合理，可調節樹體負荷，改善果園通風透光條件，促進果樹健康生長，提高抗病蟲能力。結合修剪，剪掉卷葉蛾、桃蚜、瘤蚜、紅蜘蛛等樹枝上的病蟲害，集中燒毀修剪后的病蟲害樹枝，消除越冬病蟲害。
3、深刨樹盤：樹冠下的土壤許多越冬病蟲害潛伏在土壤凍結前，深挖樹盤，一些食心蟲、梨花網蟲、梨星毛蟲、舟形毛蟲可以直接殺死土壤中越冬的部分，山楂紅蜘蛛(冬季雌成螨在根頸周圍的土壤間隙、落葉和雜草之間越冬)等。通過翻土，一些害蟲可以暴露在土壤表面。這些害蟲要么被鳥啄，要么在寒冷的冬天凍死。
4、刮去翹皮、粗皮、病瘤：樹干上的翹皮和粗皮是病蟲害的主要越冬場所，如山紅蜘蛛(冬型雌成螨)、卷葉蛾、梨小食心蟲、梨星毛蟲等都在翹皮、粗皮下越冬。刮去翹皮和粗皮可以消除上述大部分害蟲。刮除根癌病瘤和流膠病膠塊，用于根癌1%硫酸銅、80@2抗菌劑乳油50用雙液或刮除病斑40%福美砷可濕性粉劑30雙液涂抹傷口，流膠病用50%退菌特50g 50%硫懸浮劑250g混合涂藥。對減少來年的感染來源有很好的作用。對減少來年的感染來源有很好的作用。
5、保護傷口，封閉鋸切口：冬季修剪留在樹上的傷口不僅是病菌入侵的途徑，也是一些害蟲越冬的地方。加入適量豬油調和清漆或桐油，涂抹保護傷口，防止病菌入侵。