黃芩的穴種深度可以根據不同的情況進行調整，但合適的穴種深度為2-3厘米。在選擇穴種深度時，需要考慮以下幾個因素：

1. 土壤質地：如果土壤比較重、粘性或容易積水，可以選擇較淺的穴種深度，以避免種子被過多的濕度和壓實影響發芽。

2. 種子大小：黃芩種子較小，一般直徑為2-3毫米。較小的種子通常需要較淺的穴種深度，以確保種子能夠接觸到足夠的氧氣和光線。

3. 氣候條件：如果種植季節氣溫較高，如夏季，可以選擇較淺的穴種深度，以防止種子受到高溫的傷害。對于黃芩種子，一般建議將其穴種深度控制在2-3厘米左右。但具體的穴種深度還是要根據您所在的地理位置、土壤條件和當地的種植經驗進行調整。